Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSBP4Q9BWG4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms