Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM62Q9BVG3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM62Q9BVG3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms