Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PAGR1Q9BTK6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAGR1Q9BTK6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms