Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHCHD5Q9BSY4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHCHD5Q9BSY4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms