Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP2Q9BSJ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBGCP2Q9BSJ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms