Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK0

REEP2, Receptor expression-enhancing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP2Q9BRK0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
REEP2Q9BRK0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
REEP2Q9BRK0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REEP2Q9BRK0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms