Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 BPHL-202ENST00000380375 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CEMIP-204ENST00000495041 385 ntTSL 511.23□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 WDR62-206ENST00000589953 664 ntTSL 311.16□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EIF3D-212ENST00000496875 604 ntTSL 411.12□□□□□ -0.632e-12■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RPS6KA1-206ENST00000438977 639 ntTSL 311.05□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PPP1R12B-218ENST00000634903 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 TUBGCP4-202ENST00000561691 1928 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CC2D1B-206ENST00000460370 577 ntTSL 210.85□□□□□ -0.671e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 BORCS7-202ENST00000369883 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 VSIG10-210ENST00000545259 560 ntTSL 410.77□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB14-201ENST00000357006 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZNF799-204ENST00000595766 576 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SRP68-208ENST00000588736 2532 ntTSL 210.33□□□□□ -0.763e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 HPS5-203ENST00000396253 4725 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.773e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RUFY3-204ENST00000502653 2342 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SEMA4B-214ENST00000560003 566 ntTSL 310.17□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ACBD5-204ENST00000375905 3848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EXO1-202ENST00000366548 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 HPS5-206ENST00000531848 2160 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.783e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 UBE3B-207ENST00000537063 3600 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-214ENST00000542858 564 ntTSL 39.95□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MAMSTR-204ENST00000595591 415 ntTSL 39.9□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RUFY3-212ENST00000513597 867 ntTSL 39.72□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PPP1R12B-208ENST00000465284 564 ntTSL 49.62□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ZBTB14-207ENST00000614697 3341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ITPR1-215ENST00000490572 632 ntTSL 49.51□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MYO1E-210ENST00000560749 952 ntTSL 39.48□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PPP1R12B-206ENST00000462074 551 ntTSL 49.16□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RUFY3-206ENST00000503876 531 ntTSL 49.15□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SNX13-208ENST00000482558 1139 ntTSL 29.09□□□□□ -0.953e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SNX13-201ENST00000409076 3818 ntTSL 29□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 LMBR1L-226ENST00000552449 277 ntTSL 38.88□□□□□ -0.997e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MFHAS1-202ENST00000520091 585 ntTSL 48.73□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 HPS5-201ENST00000349215 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-207ENST00000538377 708 ntTSL 28.62□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC8.24□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.13e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 GEMIN5-203ENST00000523355 557 ntTSL 47.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 KCTD10-212ENST00000541077 538 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ANKRD37-206ENST00000511393 1444 ntTSL 27.96□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 STAG1-209ENST00000492318 570 ntTSL 57.81□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.183e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EXO1-204ENST00000437497 593 ntTSL 37.69□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.193e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 BAZ2B-201ENST00000294905 631 ntTSL 47.57□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.223e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 POM121C-202ENST00000439629 575 ntTSL 57.39□□□□□ -1.236e-9■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ACSL3-203ENST00000407441 538 ntTSL 37.14□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ANKRD37-202ENST00000506424 519 ntTSL 37.09□□□□□ -1.273e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 THBS1-208ENST00000560894 537 ntTSL 26.99□□□□□ -1.293e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 AC012254.2-202ENST00000602926 291 ntAPPRIS ALT2 TSL 26.83□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PICALM-205ENST00000526548 738 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.378e-19■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RAPGEF6-212ENST00000513227 560 ntTSL 46.48□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RAPGEF6-204ENST00000504039 542 ntTSL 46.48□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PICALM-206ENST00000526907 737 ntTSL 56.35□□□□□ -1.398e-19■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SLC2A9-210ENST00000508585 398 ntTSL 36.1□□□□□ -1.433e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 ACSL3-208ENST00000495541 749 ntTSL 26.06□□□□□ -1.443e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RAPGEF6-205ENST00000504575 552 ntTSL 45.9□□□□□ -1.462e-7■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 CDC25A-205ENST00000459900 767 ntTSL 35.85□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 USP34-219ENST00000492604 527 ntTSL 45.85□□□□□ -1.471e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.493e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 USP34-203ENST00000436269 1827 ntTSL 54.84□□□□□ -1.631e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.693e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 RALGAPA1-211ENST00000555828 125 ntTSL 34.12□□□□□ -1.751e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 DEPDC5-214ENST00000469974 640 ntTSL 53.77□□□□□ -1.813e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PAPOLG-207ENST00000496283 4193 ntTSL 1 (best)3.29□□□□□ -1.883e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PAPOLG-203ENST00000414060 3511 ntTSL 1 (best)2.99□□□□□ -1.933e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 PAPOLG-204ENST00000453839 3324 ntTSL 1 (best)2.68□□□□□ -1.983e-6■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.311e-11■■■■■ 30.2
BUD13Q9BRD0 SNRNP200-203ENST00000480242 3409 ntTSL 29.09□□□□□ -0.951e-8■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 MRPL38-205ENST00000471434 550 ntTSL 413.97□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 TMEM123-203ENST00000525577 550 ntTSL 45.07□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 TMEM123-206ENST00000529492 549 ntTSL 23.82□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 ATP5B-208ENST00000551182 457 ntTSL 27.59□□□□□ -1.193e-33■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 EGLN3-209ENST00000553215 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 315.79■□□□□ 0.127e-14■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 AHSG-201ENST00000273784 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-74■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 AHSG-202ENST00000411641 1711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.582e-74■■■■■ 30.1
BUD13Q9BRD0 RAD23A-208ENST00000591499 1350 ntTSL 223.43■■□□□ 1.342e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RAD23A-204ENST00000588329 1034 ntTSL 520.84■□□□□ 0.936e-11■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.652e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RAD23A-202ENST00000586375 894 ntTSL 318.13■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RAD23A-210ENST00000593114 1691 ntTSL 517.84■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RAD23A-205ENST00000588826 832 ntTSL 515.48■□□□□ 0.076e-11■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 USP21-210ENST00000493054 770 ntTSL 513.01□□□□□ -0.339e-7■■■■■ 30
BUD13Q9BRD0 USP21-206ENST00000485277 863 ntTSL 510.64□□□□□ -0.719e-7■■■■■ 30
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