Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM83CQ9BQN1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM83CQ9BQN1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM83CQ9BQN1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms