Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX50Q9BQ39 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DDX50Q9BQ39 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DDX50Q9BQ39 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms