Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM4BQ9BQ04 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM4BQ9BQ04 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM4BQ9BQ04 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms