Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARID3AQ99856 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARID3AQ99856 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARID3AQ99856 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms