Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSG101Q99816 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSG101Q99816 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms