Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBBP8Q99708 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBBP8Q99708 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RBBP8Q99708 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms