Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITX2Q99697 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX2Q99697 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX2Q99697 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms