Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPS8Q99627 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPS8Q99627 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms