Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CSF3RQ99062 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF3RQ99062 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSF3RQ99062 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms