Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDRT15Q96T59 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDRT15Q96T59 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDRT15Q96T59 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms