Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC41.78■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.76■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RSF1Q96T23 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC41.73■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.27
RSF1Q96T23 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC41.65■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC41.63■■■■■ 4.26
RSF1Q96T23 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
RSF1Q96T23 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms