Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNL2Q96S94 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCNL2Q96S94 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCNL2Q96S94 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms