Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2CR12Q96Q35 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALS2CR12Q96Q35 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms