Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCEEQ96PE7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCEEQ96PE7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms