Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCMTD1Q96MG8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCMTD1Q96MG8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCMTD1Q96MG8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms