Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NSMCE2Q96MF7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSMCE2Q96MF7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms