Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf85Q96MD7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf85Q96MD7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms