Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00477Q96M19 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00477Q96M19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms