Protein–RNA interactions for Protein: Q96LZ7

RMDN2, Regulator of microtubule dynamics protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN2Q96LZ7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RMDN2Q96LZ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RMDN2Q96LZ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms