Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PKNOX2Q96KN3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PKNOX2Q96KN3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PKNOX2Q96KN3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms