Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TMX3Q96JJ7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMX3Q96JJ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMX3Q96JJ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms