Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ6

JPH4, Junctophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH4Q96JJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
JPH4Q96JJ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
JPH4Q96JJ6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC37.4■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
JPH4Q96JJ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
JPH4Q96JJ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms