Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH6

TMEM19, Transmembrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM19Q96HH6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM19Q96HH6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM19Q96HH6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms