Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
LTV1Q96GA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
LTV1Q96GA3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTV1Q96GA3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms