Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TVP23CQ96ET8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TVP23CQ96ET8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TVP23CQ96ET8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms