Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC126Q96EE4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC126Q96EE4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC126Q96EE4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms