Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RAB3CQ96E17 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RAB3CQ96E17 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.4 ms