Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MS4A6EQ96DS6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MS4A6EQ96DS6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms