Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RMDN1Q96DB5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RMDN1Q96DB5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms