Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SDCCAG3Q96C92 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SDCCAG3Q96C92 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms