Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ROPN1LQ96C74 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ROPN1LQ96C74 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ROPN1LQ96C74 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ROPN1LQ96C74 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ROPN1LQ96C74 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms