Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLDN23Q96B33 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN23Q96B33 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN23Q96B33 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN23Q96B33 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN23Q96B33 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN23Q96B33 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN23Q96B33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN23Q96B33 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms