Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC10Q969S8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC10Q969S8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC10Q969S8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms