Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL2Q969S2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEIL2Q969S2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEIL2Q969S2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms