Protein–RNA interactions for Protein: Q969G2

LHX4, LIM/homeobox protein Lhx4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4Q969G2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LHX4Q969G2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LHX4Q969G2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms