Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
BRF1Q92994 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRF1Q92994 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRF1Q92994 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms