Protein–RNA interactions for Protein: Q92968

PEX13, Peroxisomal membrane protein PEX13, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX13Q92968 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX13Q92968 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX13Q92968 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PEX13Q92968 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX13Q92968 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX13Q92968 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX13Q92968 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PEX13Q92968 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PEX13Q92968 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PEX13Q92968 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms