Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
UFD1Q92890 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
UFD1Q92890 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms