Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CDKL2Q92772 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDKL2Q92772 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms