Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
TNRQ92752 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNRQ92752 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNRQ92752 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNRQ92752 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TNRQ92752 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TNRQ92752 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNRQ92752 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TNRQ92752 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
TNRQ92752 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNRQ92752 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TNRQ92752 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNRQ92752 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNRQ92752 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TNRQ92752 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC33.81■■■■□ 3
TNRQ92752 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TNRQ92752 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TNRQ92752 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNRQ92752 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNRQ92752 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TNRQ92752 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNRQ92752 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
TNRQ92752 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TNRQ92752 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TNRQ92752 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TNRQ92752 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TNRQ92752 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TNRQ92752 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TNRQ92752 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
TNRQ92752 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNRQ92752 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TNRQ92752 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNRQ92752 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TNRQ92752 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNRQ92752 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNRQ92752 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TNRQ92752 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TNRQ92752 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TNRQ92752 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
TNRQ92752 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TNRQ92752 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNRQ92752 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNRQ92752 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNRQ92752 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNRQ92752 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNRQ92752 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TNRQ92752 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNRQ92752 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNRQ92752 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNRQ92752 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNRQ92752 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TNRQ92752 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TNRQ92752 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TNRQ92752 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNRQ92752 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNRQ92752 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNRQ92752 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TNRQ92752 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms