Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A6Q92581 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A6Q92581 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms