Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATG4AQ8WYN0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4AQ8WYN0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms