Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASKIN2Q8WXE0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASKIN2Q8WXE0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASKIN2Q8WXE0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms